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    作物抗逆育種領(lǐng)域的“科技與狠活” :高通量植物表型+分子組學(xué)

    發(fā)布時(shí)間: 2026-01-29  點(diǎn)擊次數(shù): 31次

    在氣候變化加劇、糧食安全受嚴(yán)峻挑戰(zhàn)背景下,作物抗逆育種與脅迫響應(yīng)機(jī)制研究是農(nóng)業(yè)科學(xué)核心議題。傳統(tǒng)研究存在局限,要么僅宏觀觀察表型,難觸及分子調(diào)控本質(zhì);要么聚焦單一組學(xué)微觀解析,缺與實(shí)際表型動(dòng)態(tài)關(guān)聯(lián),難破解復(fù)合脅迫復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。PlantScreen高通量植物表型系統(tǒng)和多組學(xué)技術(shù)的聯(lián)合應(yīng)用,正逐漸成為抗逆育種研究領(lǐng)域里關(guān)鍵的技術(shù)手段。該系統(tǒng)借助表型數(shù)據(jù),捕捉植物對(duì)外界脅迫的宏觀響應(yīng),運(yùn)用多組學(xué)解析分子調(diào)控機(jī)制,迅速建立表型 - 組學(xué)的對(duì)應(yīng)關(guān)系,揭示作物脅迫響應(yīng)的多水平調(diào)控邏輯,為抗逆品種培育提供了高通量、高精度的技術(shù)支持。

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    馬鈴薯作為四大主糧,雖兼具水分和空間利用效率優(yōu)勢,卻對(duì)多重脅迫極為敏感,單一或復(fù)合脅迫可導(dǎo)致減產(chǎn)甚至絕收。一項(xiàng)由德國、荷蘭、英國、捷克等7國科研團(tuán)隊(duì)的聯(lián)合研究在《Plant Physiology》發(fā)表重磅成果——借助PlantScreen™高通量表型平臺(tái)的動(dòng)態(tài)監(jiān)測能力,結(jié)合轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組、代謝組、激素組的多組學(xué)整合分析,成功解析了馬鈴薯對(duì)單一及復(fù)合非生物脅迫的全維度響應(yīng)機(jī)制。

     

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    動(dòng)態(tài)表型監(jiān)測:PlantScreen捕獲脅迫響應(yīng)的實(shí)時(shí)軌跡"

    在這項(xiàng)覆蓋5種脅迫處理(高溫、干旱、水澇、高溫+干旱、高溫+干旱+水澇)的研究中,PlantScreen平臺(tái)承擔(dān)了“全天候表型監(jiān)測官"的角色。研究團(tuán)隊(duì)選取中度抗逆的馬鈴薯Desirée品種,通過平臺(tái)集成的RGB成像、葉綠素?zé)晒獬上瘛岢上竦榷鄠鞲衅髂K,實(shí)現(xiàn)了每日無侵入式數(shù)據(jù)采集。

    形態(tài)學(xué)特征來看,PlantScreen精準(zhǔn)捕捉到不同脅迫下的獨(dú)特表型信號(hào):高溫脅迫導(dǎo)致馬鈴薯葉片上卷(避熱形態(tài)建成),水澇處理1天內(nèi)即引發(fā)葉片偏上生長并伴隨生長停滯,而高溫+干旱復(fù)合脅迫下,植株體積、冠層面積的衰減速率顯著高于單一脅迫。這些動(dòng)態(tài)變化數(shù)據(jù),為后續(xù)區(qū)分“脅迫起始點(diǎn)"“響應(yīng)峰值期"“恢復(fù)關(guān)鍵期"提供了直接依據(jù)。

    生理功能監(jiān)測上,PlantScreen的葉綠素?zé)晒獬上窦夹g(shù)精準(zhǔn)量化了光合系統(tǒng)IIPSII)的運(yùn)行效率(QY_Lss)和開放反應(yīng)中心比例(qL_Lss),發(fā)現(xiàn)水澇脅迫3天后PSII效率顯著下降,而高溫脅迫對(duì)光合系統(tǒng)的損傷具有持續(xù)性,即使脅迫解除也難以恢復(fù)至對(duì)照水平。熱成像模塊捕獲的冠層與空氣溫差(ΔT),則揭示了不同脅迫下的氣孔行為策略:干旱和水澇時(shí)氣孔快速關(guān)閉導(dǎo)致ΔT升高,高溫時(shí)氣孔開放散熱則使ΔT降低,這些生理表型數(shù)據(jù)為解讀激素和代謝物變化提供了關(guān)鍵線索。

    值得一提的是,PlantScreen自動(dòng)化數(shù)據(jù)采集能力保障了實(shí)驗(yàn)的高通量與重復(fù)性。6組處理、36株表型監(jiān)測植株,每日生成的68項(xiàng)形態(tài)-生理變量,通過平臺(tái)自帶的PlantScreenAnalyzer軟件自動(dòng)提取,為后續(xù)與多組學(xué)數(shù)據(jù)的整合奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

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    表型-組學(xué)聯(lián)動(dòng):PlantScreen解鎖分子機(jī)制的解碼鑰匙"

    如果說多組學(xué)數(shù)據(jù)是解析脅迫響應(yīng)的“分子密碼本",那么PlantScreen獲取的表型數(shù)據(jù)就是的“鑰匙"。該研究通過機(jī)器學(xué)習(xí)算法篩選出6個(gè)核心表型變量(qL_Lss、PSII熒光效率、冠層面積、ΔT、植株緊湊度、水分消耗),與轉(zhuǎn)錄組的14個(gè)標(biāo)記基因、蛋白質(zhì)組的36個(gè)功能蛋白、代謝組的22種核心代謝物及13種植物激素進(jìn)行整合分析,實(shí)現(xiàn)了“表型變化-分子響應(yīng)"的精準(zhǔn)對(duì)應(yīng)。

    研究發(fā)現(xiàn),水澇脅迫下PlantScreen監(jiān)測到的氣孔快速關(guān)閉,與激素組中ABA及其降解產(chǎn)物PADPA的顯著積累高度同步,證實(shí)了水澇脅迫會(huì)激活類似干旱的ABA信號(hào)通路——這一發(fā)現(xiàn)依賴于表型數(shù)據(jù)捕捉到的“瞬時(shí)響應(yīng)"與激素組學(xué)的“時(shí)序變化"的聯(lián)動(dòng)分析。而高溫+干旱復(fù)合脅迫下,PlantScreen記錄到的植株體積驟減變化,對(duì)應(yīng)著代謝組中組氨酸、支鏈氨基酸的大量積累,以及蛋白質(zhì)組中熱休克蛋白(HSP70、HSP90)的富集,揭示了復(fù)合脅迫通過“代謝重構(gòu)+蛋白保護(hù)"應(yīng)對(duì)脅迫的協(xié)同機(jī)制。

    更重要的是,PlantScreen捕獲的動(dòng)態(tài)表型數(shù)據(jù),糾正了傳統(tǒng)“靜態(tài)采樣"的局限。例如,單一干旱脅迫下,植株在脅迫第7天出現(xiàn)ΔT顯著升高,此時(shí)轉(zhuǎn)錄組中P5CS(脯氨酸合成關(guān)鍵基因)和RD29B(干旱標(biāo)記基因)才達(dá)到表達(dá)峰值,而PlantScreen的每日監(jiān)測明確了“表型變化先于分子響應(yīng)"的時(shí)間差,為理解脅迫適應(yīng)的調(diào)控時(shí)序提供了直接證據(jù)。

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    育種應(yīng)用潛力:PlantScreen加速抗逆品種培育的“轉(zhuǎn)化橋梁"

    該研究的核心價(jià)值不僅在于機(jī)制解析,更在于為抗逆育種提供了可落地的高通量分析技術(shù)方案——而PlantScreen正是連接基礎(chǔ)研究與育種應(yīng)用的“轉(zhuǎn)化橋梁"。本研究通過PlantScreen表型數(shù)據(jù)與多組學(xué)數(shù)據(jù)的整合,篩選出一批與關(guān)鍵表型強(qiáng)關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記:如與光合效率維持相關(guān)的HSP70基因、與水分利用效率關(guān)聯(lián)的DPA代謝物、與塊莖產(chǎn)量保護(hù)相關(guān)的SP6A基因。

    這些標(biāo)記的篩選,依賴于PlantScreen對(duì)“目標(biāo)表型"的精準(zhǔn)量化——例如,通過平臺(tái)監(jiān)測到的“脅迫后恢復(fù)能力"這一關(guān)鍵表型,鎖定了ABA代謝通路的核心作用,為育種家提供了可直接用于分子標(biāo)記輔助選擇的靶點(diǎn)。此外,PlantScreen的高通量特性可支持大規(guī)模種質(zhì)資源的快速篩選,相較于傳統(tǒng)表型鑒定效率提升數(shù)十倍,為抗逆品種的快速培育提供了技術(shù)支撐。

    PlantScreen作物脅迫研究進(jìn)入表型-組學(xué)"整合時(shí)代

    這項(xiàng)跨國研究充分證明,PlantScreen高通量表型平臺(tái)不僅是表型數(shù)據(jù)的“采集器",更是多組學(xué)研究的“核心錨點(diǎn)"。其自動(dòng)化、多維度、動(dòng)態(tài)監(jiān)測的優(yōu)勢,解決了傳統(tǒng)研究中表型與分子數(shù)據(jù)脫節(jié)的痛點(diǎn),實(shí)現(xiàn)了“形態(tài)-生理-分子"的全鏈條解析。

    在氣候變化加劇的今天,作物抗逆研究亟需從“單一脅迫"轉(zhuǎn)向“復(fù)合脅迫",從“靜態(tài)分析"轉(zhuǎn)向“動(dòng)態(tài)追蹤"。PlantScreen平臺(tái)的應(yīng)用,不僅為馬鈴薯抗逆研究提供了新范式,更為小麥、玉米、番茄等其他作物的脅迫響應(yīng)研究提供了可復(fù)制的技術(shù)方案。未來,隨著表型組學(xué)與多組學(xué)整合技術(shù)的不斷成熟,PlantScreen將持續(xù)賦能抗逆育種,助力培育更多氣候適應(yīng)性強(qiáng)、產(chǎn)量穩(wěn)定的作物品種,為糧食安全筑牢技術(shù)屏障。

    北京易科泰攜手PSI表型研究中心,先后在國內(nèi)安裝運(yùn)行多臺(tái)PlantScreen高通量植物表型成像分析平臺(tái),該表型平臺(tái)集成了定制光源、自動(dòng)澆灌稱重、多種表型成像單元及自動(dòng)化系統(tǒng),目前裝機(jī)近百臺(tái)。客戶涵蓋幾乎所有遺傳育種表型研究機(jī)構(gòu)或公司(北京易科泰PlantScreen國內(nèi)外用戶名錄),如國際水稻研究所、瓦格寧根大學(xué)及巴斯夫、杜邦先鋒等農(nóng)業(yè),在高通量植物表型分析領(lǐng)域處于市場地位。

    杜邦先鋒:PlantScreen表型成像分析系統(tǒng)用于玉米育種

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    德國IPK大型PlantScreen植物表型成像平臺(tái)

     

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    荷蘭瓦格寧根大學(xué)PlantScreen傳送帶版高通量植物表型成像分析系統(tǒng)

     

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    澳大利亞悉尼科技大學(xué)PlantScreen藻類表型成像分析系統(tǒng)

     

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    匈牙利生物科學(xué)研究中心: PlantScreen 植物根系表型成像分析系統(tǒng)

     

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    北京易科泰PlantScreen高通量植物表型成像分析平臺(tái)鏈接 


    1. Zagor??ak M, Abdelhakim L, Rodriguez-Granados N Y, et al. Integration of multi-omics data and deep phenotyping provides insights into responses to single and combined abiotic stress in potato[J]. Plant physiology, 2025, 197(4): kiaf126.


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